确定病因已知疾病的来源研究病因未知疾病的防制对策获取有关疾病自然史的资料制定和监测疾病防制规划估价疾病防制的经济影响

很多病因已知的疾病可以根据受害动物表现的症状和病变，适当的实验室试验和其他临诊方法作出诊断。–例如，在一群犊牛中作出沙门氏菌病的诊断是比较容易的事，因为感染产生特别的临诊症状。但是，要确定为什么会引起该次暴发，并使用正确的方法防止再发，则可能困难得多。因此，需要作进一步研究才能确定感染的来源。对这类病因已知疾病作流行病学研究，要回答的问题往往是：为什么会暴发?为什么病例数会增加?

根据流行病学研究的结果，在致病因子搞清楚之前就把疾病控制住，这在历史上有很多例子。–根据牛传染性胸膜肺炎的接触传染性质，在其病原体丝状支原体分离出来之前十多年，美国已消灭了这种一度严重流行的疫病。

在18世纪牛瘟在欧洲流行十分猖獗，虽然当时对其病原体一无所知，但是根据该病是可以传染的这一流行病学观察，Lancisi氏提出了扑杀患病牛群的对策，成功地使罗马地区的健康牛群免受其害。–EdwardJenner氏在分离出天花病毒之前的18世纪，根据感染牛痘的挤奶女工能抵抗天花的经典发现，首创牛痘苗，为全球消灭天花奠定了基础。

牛的古典型恶性卡他热和我国在60年代发现的水牛类恶性卡他热，虽然至今还没有分离到病原体，但流行病学研究表明，前者的传播是绵羊介导的，后者的传播是山羊介导的，采取防止绵羊和山羊与牛群接触的相应措施，能有效地控制这两种病。

所谓疾病的自然史，是指疾病的分布和感染的传播和维持的生态学机理及宿主、致病因子和环境病因因素。–能被一种传染性病原体感染的动物称为该病原体的宿主。宿主和病原体都生活在特定的环境中。

传染性病原体的自然史只有放在宿主生态系统的范围内进行研究，才能全面了解。同样，研究生态系统及其有关的物理特性，也可加深对非传染病的认识。–例如，一个生态系统的地理结构可以影响植物的矿物质含量，因此可能成为影响动物发生矿物质缺乏或过量的重要因素。

一个生态系统的环境可影响传染性病原体及其宿主的存活率。–譬如，只有在排水不良的牧地放牧，牛羊才会发生肝片形吸虫的严重感染，因为该寄生虫生活史的一部分需要在椎实螺中渡过，而这种螺只能生活在潮湿的环境中。

生态系统的气候条件是影响疾病流行的重要因素，因为它通过限制节肢动物的分布进而限制虫媒传染性病原体的地理分布。